保生大帝於宋景祐三年(西元一○三六年)五月初二日羽化昇天得年58歲,關於大帝昇天的傳說有二敘述如下:

1、 宋景祐三年(1036)農曆五月初二午時,保生大帝在文圃山龍池岩,為了採草藥煉丹,救治瘟疫患者,不慎跌入坑岩之中,眾人急忙救起,扶回龍秋坑茅屋,因受傷過重,一代名醫就此羽化。

2、 另一種傳說是:宋景祐三年(1036)大帝靜坐修鍊功成圓滿,於五月初二午時,偕同大姐吳明媽,姐夫王舍人,門人張聖者、江仙官及書僮在白礁故鄉,騎乘仙鶴白日飛昇,鄉人目睹此景,紛紛排列香案恭送。 無論其飛昇真實性如何?都不會影響我們對於一代醫神的崇敬與孺慕。

本宮於農曆五月初二大帝升天之日由道士舉行隆重科儀,帶領本宮董監事及信徒大眾集體團拜,過程莊嚴肅穆。